إن مشروع الترميم المشترك بالمتحف المصري الكبير هو استمرار للتعاون ما بين هيئة الجايكا مع المتحف المصري الكبير والذي بدأ منذ عام 2010.

يشارك في هذا المشروع أكثر من 40 خبير ياباني و60 خبير مصري، بهدف نقل وفحص وترميم 72 قطعة أثرية مختارة من قبل هذا المشروع، ليتم عرضهم في المتحف المصري الكبير.

تنقسم هذه القطع الى 3 مجموعات طبقاً لخاماتها إلى: مجموعة الأخشاب ومجموعة النسيج ومجموعة النقوش الجدارية. حيث تضم مجموعة الأخشاب 3 سرائر جنائزية و5 عجلات حربية تابعة لكنوز الملك توت عنخ امون. وتضم مجموعة النسيج 57 قطعة نسيج أيضاً تابعة للملك الذهبي. وتضم مجموعة النقوش الجدارية 6 مجموعات من النقوش الجدارية المستخرجة من مسطبة اني سنفرو ايشت اف.

  في 16 ديسمبر عام 2016، بدأ المشروع باجتماع لجنة التنسيق المشترك بين الجانبي المصري والياباني تحت اشراف د/ طارق توفيق، المشرف العام على مشروع المتحف المصري الكبير، ووزير الآثار د/ خالد العناني.

كما يوفر هذا المشروع أحدث الخامات والأجهزة لمركز ترميم المتحف المصري الكبيرGEM-CC  في مجال لفحص القطع الأثرية، مما يساعد كثيراً في وضع خطط ترميم مناسبة لكل قطعة.

يساعد هذا المشروع في تحقيق هدف الGEM-CC، وهو تنمية قدرات الخبراء العاملين بالمركز عن طريق التعاون ومشاركة الخبرات مع متخصصين من مختلف أنحاء العالم.